Dans Deus Ex, La biosphère Terrestre a preque completement disparu, la couche d'ozone comporte trop de trous, les callotes on fondu, le taux de CO2 est alarmant, bref, la Terre est dans un état lamentable.
Toute l'énergie viens du soleil, et les moteurs à combustion fossile ont disparus. Tout le monde est branché sur un gigantesque réseau informaique, le "Big-Board". De plus, ont peu créer un double de sa personnalité pour l'implanter dans un clone qui nous remplaceras, accédant ainsi a une pseudo-immortalité.
L'Église, la Sainte institution de Dieu, voit sa popularité baisser de façon alarmante a cause de la Bulle Papale a ce sujet, qui dit que ces "entités successibles" ne sont pas des âmes, et qu'en créer est un péché satanique.
Un vieux noir accro au Cannabis sera chargé de retrouver "un prêtre" ou plutôt le programme du prêtre, envoyé dans le système par la Papesse Mary 1ère pour prouver une fois pour toute si l'âme est un programme ou pas.